El Museo Naval de Madrid es una entidad de titularidad estatal, dependiente del Ministerio de Defensa, regida por un Real Patronato.
El museo se ha concebido como una institución viva y abierta al gran público, que además de la conservación, estudio, exposición e incremento de sus fondos, sirva de instrumento de comunicación y educación de la historia marítima de España para salvaguardar sus tradiciones y promover la conciencia marítima nacional. Sus objetivos prioritarios se enmarcan en el fomento del conocimiento en los siguientes campos:
- La historia de la Marina Española
- La construcción naval
- La náutica y sus ciencias auxiliares: cosmografía, cartografía e instrumentos
- La historia de los viajes marítimos y los descubrimientos
- La Arqueología Subacuática
- El patrimonio inmaterial marinero