Destaca el Museo Casa de Cervantes (Valladolid) por haber tenido el crecimiento de visitantes más significativo, con un 66,7% más que en 2015. En esta misma ciudad también cabe mencionar las visitas al Museo Nacional de Escultura, 193.665, con un aumento del 20,77%.
En Madrid, el Museo del Traje, además de superar los cien mil visitantes en 2016, ha registrado un crecimiento del 37,9%. Otros dos museos ubicados en Madrid que registran grandes crecimientos son el del Romanticismo, con un total de 97.791 visitas en 2016 (un 29,1% más que en 2015), y el Museo Cerralbo, con un crecimiento del 23,8%, superando las 130.000 visitas anuales.
Con aumentos en el número de visitas que superan el 10% se encuentran el Museo de América (15,5%), el Museo Sefardí (14,6%), Museo Sorolla (14,5%), el Museo Nacional de Antropología (13,3%), el Museo Nacional de Cerámica y Artes Suntuarias (12,6%) y el Museo Nacional de Arte Romano (10,5%).
El Museo de Altamira, en Santilla del Mar, ha aumentado las visitas en un 8,62%, hasta las 285.990. Los museos que registran un público cuantitativamente similar al de 2015 son ARQUA, ubicado en Cartagena, con 104.288 visitas y un ligero incremento del 3,73%; el Museo Nacional de Artes Decorativas, situado en Madrid, con 34.892 visitas y un aumento del 0,57%, y el Museo del Greco, ubicado en Toledo, con 236.887 visitantes y un pequeño descenso del 0,53%.
El Museo Arqueológico Nacional se consolida como el más visitado (507.253 en 2016) y registra, una vez superado el impacto de su exitosa reinauguración en 2014, un descenso del 8,77%.