Sus recreaciones desnudas de diosas hindúes le convirtieron en el objetivo de la violencia de radicales hindúes, que le acusaron de obscenidad, lo que le llevó a abandonar India y aceptar el pasaporte que le ofreció Qatar en el año 2010.
MF Husain era conocido, además de por aparecer descalzo en los actos sociales más exclusivos, por influir en varias generaciones de artistas indios. En declaraciones a la BBC, su colega Anjolie Ela Menon destacó que «su ingente obra es comparable a la de Pablo Picasso. MF Husain nunca envejeció. Mantenía su energía, su humor y su increíble capacidad para trabajar. Era incansable. A menudo comentaba que nunca había tenido una habitación para dormir. Era un nómada. Un gitano».
En 2006, tras exiliarse, el artista pidió públicamente perdón por su cuadro Madre India, que muestra a una mujer desnuda arrodillada en el suelo formando los contornos del mapa de su país.
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