El secreto de sus ojos obtuvo el Goya a la mejor película hispanoamericana y a la mejor actriz revelación, que premió a la argentina Soledad Villamil. Ágora, de Alejandro Amenábar, logró siete premios, de los trece a los que optaba: efectos especiales, fotografía, dirección artística, maquillaje y peluquería, vestuario, dirección de producción y guión original.
Raúl Arévalo fue el mejor actor de reparto por Gordos. Le siguió, en el mismo apartado, Marta Etura por Celda 211. Lola Dueñas fue la mejor actriz por Yo, también. Alberto Iglesias consiguió el octavo Goya de su carrera por la banda sonora de Los abrazos rotos, de Pedro Almodóvar. Alberto Ammann fue el actor revelación por Celda 211. El Goya a la mejor dirección novel fue para Mar Coll por Tres días con la familia y el mejor documental fue Garbo. El hombre que salvó el mundo. El Goya de Honor, y el homenaje más sentido de la noche, fue para Antonio Mercero, que no pudo asistir a la ceremonia.