Desde 1988, cuando fue calificada como fundación benéfico-cultura, la ‘Carlos de Amberes‘ viene colaborando con Patrimonio Nacional en distintos programas y actividades, entre los que destacan la exposición de tapices flamencos del Renacimiento que viajó a Gante (2009) y a París (2010); la muestra La Belleza y la Locura (2006-2007), que inauguró el Rey en la Casa del Cordón de Burgos y que fue presentada después en Brujas dentro de la conmemoración del V Centenario de Felipe I el Hermoso; o la dedicada al Real Alcázar.

Ambas instituciones han impulsado, además, conciertos de intérpretes escogidos, como el del repertorio renacentista de la Capilla Borgoñona en el Real Monasterio de la Encarnación y los de los virtuosos de la Escuela Reina Elisabeth en el Real Monasterio de Yuste (2008), Palacio Real de la Almudaina en Palma (2009) y Real Monasterio de Santa Isabel (2010).